马克思主义学院伴随重庆人文科技学院（含前身“西南师范大学行知育才学院”、“西南师范大学育才学院”、“西南大学育才学院”）的诞生和发展全过程。其前身可追溯至学校办学之初（2000年9月）经济政法系内设的“马克思主义理论课和思想品德课”（简称“两课”）协调组。

2003年9月，经济政法系更名为经济政法学院，“两课”协调组改设为“两课”教研室，专门负责安排和承担全校的马克思主义理论课和思想品德课的教学任务等。

2004年8月，学校将“两课”教研室升格为“两课”教学部（二级教学单位），与经济政法学院合署办公，实行“两块牌子，一套人马”。负责全校马克思主义理论课和思想品德课的教学工作。

2006年，学校根据中宣部、教育部的文件要求，将“两课”教学部更名为“思想政治理论课”教学部，与政治法律学院合署办公，实行“两块牌子，一套人马”。

2013年，学校转制更名为重庆人文科技学院。随后，学校又将“思想政治理论课教学部”和体育系等组合成“基础教学部”，保留“思想政治理论课教学部”牌子，继续实行“两块牌子，一套人马”。

2015年，学校撤销“基础教学部”，分别组建体育学院和“思想政治理论课教学部”。不久，“思想政治理论课教学部”与“政治法律学院”合署，组建新的政治与法律学院，同时保留“思想政治理论课教学部”牌子，实行“两块牌子，一套人马”。

2018年7月，学校将“思想政治理论课教学部”独立出来，组建马克思主义学院。

经过20多年的孕育和发展，马克思主义学院现已成长为学校思想政治理论课教育教学、马克思主义理论研究、党的路线方针政策宣传等的坚强主阵地。

马克思主义学院现有教职工74人（含兼职），其中教授9人（含兼职），副教授19人（含兼职）。拥有与重庆三峡学院合作培养硕士研究生导师2人（不含兼职）。

马克思主义学院组建有马克思主义学院直属党支部、工会（教代会）；

下设综合办公室、教务（科研）办公室；

建有马克思主义基本原理教学系、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论（习近平新时代中国特色社会主义思想概论）教学系、思想道德与法治教学系、中国近现代史纲要教学系、形势与政策教学系等教学组织；

设有“思政课实践教学教研室”、“思政选修课教研室”和“学生社团指导团队”等教学科研机构。

经过20多年努力，学院现有一个学校“优秀教学部系”：马克思主义基本原理教学系；两个学校“一流教学团队”：“毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论”教学团队和思想政治理论课实践教学团队等。2人两次获重庆市普通高等院校（本科）思政课青年教师教学能力大赛三等奖。

马克思主义学院坚守“马院姓马，马院言马，马院尊马”初心和使命，秉持“厚德明理，博学创新”（院训）“崇尚真理，马到成功”（学院精神）“马院启航，青春激扬”（学院口号）的理念，立足教育教学，创新教改科研，融入陶行知“千教万教，教人求真；千学万学，学做真人”的教育思想，紧紧围绕教育教学中心工作党建抓，抓好党建促思政改革发展，不断提高学校思想政治理论教育的针对性和时效性，为培养德智体美劳的中国特色社会主义时代新人贡献力量。（截止时间2022年3月）